联系我们

单细胞测序

单细胞测序是一种高精度的基因组学技术,可以用于对单个细胞进行基因组学和转录组学分析,该技术的发展使得研究人员可以深入了解细胞类型、表观遗传学、信号转导、细胞分化和癌症发生等方面的问题。
单细胞测序技术已经在许多生物医学研究领域得到了广泛应用,如癌症研究、神经科学、发育生物学、免疫学和干细胞研究等。它被用来鉴定肿瘤细胞的异质性和演化轨迹,以及对抗癌药物的反应;也被用来解析大脑神经元的亚型和联系,以及神经退行性疾病的病理机制;此外还用于检测胚胎发育时不同细胞类型的分化过程和调控机制。

 

服务流程

常见问题

一、取样注意事项: 
1.在取样时(尤其是病变组织)尽量避免取到坏死、钙化、硬化、纤维化的部位; 2.如手术为电刀切割组织,去除因与电刀接触的坏死组织; 3.确保目标组织术时无冰冻; 4.在取样后可对组织进行修剪,尽可能快速去除非目标部位然后尽快放入组织保存液中,以免影响最终测序结果。 5.消化系统组织需多用PBS或者生理盐水多次冲洗。 6.如是高龄动物标本请尽快送实验室进行解离。 7.实验模型是否会对细胞有影响,如小鼠肺部打入二氧化硅颗粒后,二氧化硅密度和细胞类似,后续无法去除干净。 8.药物治疗是否会对细胞有影响,如肿瘤治疗后,大部分肿瘤细胞凋亡后形成的碎片不易与细胞区分,影响细胞质检有核率。


二、单细胞样本重复性问题
受限于单细胞转录组技术的常见样本来自于临床设计,所以单细胞转录组对于生物学重复没有严格的要求限制。 临床样本,一般可以通过按照实验设计,增加每组的个体数目,提高数据结论的可靠性即可(例如研究乳腺癌肿瘤微环境,可以选择5个以上患有乳腺癌的个体,从整体解析细胞类型组成等信息);动物模型样本等涉及人为处理因素的设计,一般建议设计2个生物学重复以上。 另外考虑到单细胞悬液的制备对组织新鲜程度要求高,个体异型性较大,所以容易出现多批次实验产生的批次效应。一般针对生物学重复的评估也没有那么严格,只要在tSNE图上细胞分布大部分或者接近重叠,细胞亚群组成比例接近,则证明重复性是可以的。另外,就算重复性比较差的情况下,也建议先通过批次矫正分析的策略来减少批次效应对细胞分群分析的影响。